Microsoft a supprimé les outils System Inoculation, Secure Shredder et System Explorer inclus dans la version bêta 1 ainsi que l'outil Tracks Eraser qui permettait aux utilisateurs de supprimer facilement de nombreux types de fichiers temporaires liés à Internet Explorer 6, incluant les témoins (cookies), les fichiers Internet temporaires et l'historique de lecture du Lecteur Windows Media.
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