Alinhamento de seqüências oor Spaans

Alinhamento de seqüências

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Alineamiento de secuencias

voorbeelde

Um alinhamento estrutural é um tipo de alinhamento de sequências baseado na comparação da forma das moléculas.
Un alineamiento estructural es un tipo de alineamiento de secuencias basado en la comparación de la forma.

O problema relacionado do alinhamento de sequências procura identificar sequências homólogas e localizar mutações específicas que as diferenciam.
El problema relacionado del alineamiento de secuencias persigue identificar secuencias homólogas y localizar mutaciones específicas que las diferencian.

Abordagens computacionais para o alinhamento de sequências dividem-se, em geral, em duas categorias: alinhamentos globais e alinhamentos locais.
Las aproximaciones computacionales al alineamiento de secuencias se dividen en dos categorías: alineamiento global y alineamiento local.

Um alinhamento múltiplo de sequências é um alinhamento de três ou mais sequências biológicas, geralmente proteínas, ADN ou ARN.
Un alineamiento múltiple de secuencias (MSA, por sus siglas en inglés) es un alineamiento de tres o más secuencias biológicas, generalmente proteínas, ADN o ARN.

Devem ser indicados todos os parâmetros de alinhamento de sequências utilizados na análise, incluindo o cálculo da percentagem de identidade (PID).
Se facilitarán todos los parámetros de alineación de secuencias utilizados en el análisis, incluido el cálculo del porcentaje de identidad (PID).

A matriz BLOSUM (BLOcks of Amino Acid SUbstitution Matrix) é uma matriz de substituição usada para o alinhamento de sequências de proteínas.
BLOSUM (BLOcks of Amino Acid SUbstitution Matrix, o matriz de sustitución de bloques de aminoácidos) es una matriz de sustitución utilizada para el alineamiento de secuencias de proteínas.

Sequências podem ser sequências de proteínas ou sequências de ácidos nucleicos, e elas podem conter lacunas ou caracteres de alinhamento (ver alinhamento de sequências).
Las secuencia pueden corresponder a secuencias de proteínas (estructura primaria de las proteínas) o de ácidos nucleicos, y pueden contener huecos (o gaps) o caracteres de alineamiento.

Clustal é um programa de computador para alinhamento múltiplo de sequências amplamente usado.
Clustal es un programa de computadora ampliamente utilizado para realizar alineamientos múltiples de secuencias.

O NCBI é actualmente dirigido por David Lipman, um dos autores do algoritmo de alinhamento de sequências genéticas BLAST e uma figura reputada do campo da bioinformática.
El NCBI es dirigido por David Lipman, uno de los autores originales del programa de alineación de secuencias BLAST y una figura extensamente respetada en bioinformática.

Métodos de alinhamento progressivo de seqüências de produzem uma árvore filogenética por necessidade, porque eles incorporam novas seqüências no alinhamento calculado na ordem da distância genética.
Por fuerza, los métodos de alineamiento progresivo producen un árbol filogenético, porque incorporan las secuencias nuevas en el alineamiento calculado por orden de distancia genética.

Ele gera uma biblioteca de alinhamentos em pares para guiar o alinhamento múltiplo de seqüências.
Genera una biblioteca de alineamientos de pares para guiar el alineamiento múltiple de secuencias.

T-Coffee (Tree-based Consistency Objective Function For alignment Evaluation) é um software de alinhamento múltiplo de sequências que usa uma abordagem progressiva.
T-Coffee (del inglés Tree-based Consistency Objective Function For alignment Evaluation, función objetivo de coherencia basada en árbol para evaluación de alineamientos) es un software para el alineamiento múltiple de secuencias que utiliza un enfoque progresivo.

E em segundo lugar, a análise de projeto de algoritmos de programação dinâmico com exemplo aplicações em alinhamento de sequências do genoma e os protocolos de caminho mais curtos em redes de comunicação.
Y en segundo lugar, el análisis de diseño de algoritmos de programación dinámicos con ejemplo: aplicaciones en alineamiento de secuencias del genoma y los protocolos de ruta más cortos en redes de comunicación. La segunda parte se refiere a problemas NP completo y qué hacer acerca de ellos.

Em Bioinformática, um alinhamento de sequências é uma forma de organizar estruturas primárias de DNA, RNA ou proteína para identificar regiões similares que possam ser consequência de relações funcionais, estruturais ou evolucionárias entre elas.
Un alineamiento de secuencias en bioinformática es una forma de representar y comparar dos o más secuencias o cadenas de ADN, ARN, o estructuras primarias proteicas para resaltar sus zonas de similitud, que podrían indicar relaciones funcionales o evolutivas entre los genes o proteínas consultados.

FASTA pega uma dada seqüência de nucleotídeos ou de aminoácidos e busca uma base de dados de sequencias correspondentes usando um alinhamento de seqüências local para encontrar casamentos de seqüências similares na base de dados.
FASTA toma un determinado nucleótido o amino ácido y busca una correspondiente base de datos de secuencias usando alineamiento de secuencias locales para encontrar coincidencias en secuencias similares.

É uma valiosa ferramenta para a comparação de proteínas que têm poucas semelhanças entre as suas sequências, onde as relações evolutivas entre proteínas não podem ser facilmente detectadas por técnicas padrão de alinhamento de seqüências.
Es una valiosa herramienta para la comparación de proteínas con baja similitud entre sus secuencias, en donde las relaciones evolutivas entre proteínas no pueden ser fácilmente detectadas por técnicas estándares de alineamiento de secuencias.

Os alinhamentos múltiplos de sequências também se referem ao processo de alinhá-las como um conjunto de sequências.
Los alineamientos múltiples de secuencias también se refieren al proceso de alinearlas como un conjunto de secuencias.

A maior parte dos programas de alinhamento múltiplo de sequências usam métodos heurísticos em lugar de optimização global, porque identificar o alinhamento óptimo entre mais de umas poucas sequências de comprimento moderado é proibitivamente custoso computacionalmente.
La mayor parte de los programas de alineamiento múltiple de secuencias usan métodos heurísticos en lugar de optimización global, porque identificar el alineamiento óptimo entre más de unas pocas secuencias de longitud moderada es prohibitivamente costoso computacionalmente.

No entanto, definir homologias pode ser um desafio devido às dificuldades inerentes do alinhamento múltiplo de sequências.
Sin embargo, definir la homología puede ser un reto, debido a las dificultades inherentes al alineamiento múltiple de secuencias.

O formato de arquivo FASTA usado como entrada para este software é agora amplamente utilizado por outras ferramentas de busca em bancos de dados de seqüências (como o BLAST) e programas de alinhamento de sequências (Clustal, T-Coffee, etc.)
El formato fasta, usado como entrada para este programa, es ahora usado por otras herramientas de búsqueda de bases de datos de secuencias (tales como BLAST) y programas de alineamiento de secuencias (Clustal, T-Coffee, etc.).

Muitas formas de filogenia molecular estão intimamente relacionadas e fazem uso extensivo do alinhamento de seqüências na construção e refino de árvores filogenéticas, que são utilizadas para classificar as relações evolutivas entre genes homólogos representados nos genomas de espécies divergentes.
Muchas formas de filogenética molecular están muy relacionadas y hacen un uso extensivo del alineamiento de secuencias en la construcción y redefinición de los árboles filogenéticos usados para la clasificación de las relaciones evolutivas entre los genes homólogos existentes en los genomas de especies divergentes.

Um alinhamento estrutural também implica um alinhamento de sequências unidimensional a partir do qual pode calcular-se uma sequência, identidade, ou a porcentagem de resíduos que são idênticos entre as estruturas de entrada, como uma medida da proximidade à qual se encontra ambas as sequências.
Un alineamiento estructural también implica un alineamiento de secuencias unidimensional desde el que una secuencia identidad, o el porcentaje de residuos que son idénticos entre las estructuras de entrada, puede calcularse como una medida de cuán cercanamente se encuentran ambas secuencias.

Há três etapas principais: Fazer um alinhamento de seqüências Criar uma árvore filogenética (ou usar uma árvore definida-por-usuário) Usar a árvore filogenética para realizar um alinhamento múltiplo As três opções são feitas automaticamente quando você seleciona "Fazer Alinhamento completo" ("Do Complete Alignment").
Hay tres etapas importantes: Hacer un alineamiento por pares Crear un árbol filogenético (o usar un árbol definido por el usuario) Usar el árbol filogenético para llevar a cabo el alineamiento múltiple Esto es hecho automáticamente cuando seleccionas "Do Complete Alignment" ("Hacer el alineamiento completo", en español).

O alinhamento múltiplo de sequências utiliza-se para avaliar a conservação dos domínios proteicos, as estruturas terciárias e secundárias, e também aminoácidos ou nucleótidos individuais.
El alineamiento múltiple de secuencias a menudo se utiliza para evaluar la conservación de los dominios proteicos, las estructuras terciarias y secundarias, e incluso aminoácidos o nucleótidos individuales.

Ele também pode combinar alinhamentos múltiplos de seqüências obtidos anteriormente e nas versões mais recentes pode usar informações estruturais a partir de arquivos do PDB (3D Coffee).
Puede combinar, también, alineamientos múltiples obtenidos previamente y, en las últimas versiones, puede usar información estructural de archivos PDB (3D-Coffee).