profondeur de séquençage oor Engels

profondeur de séquençage

Vertalings in die woordeboek Frans - Engels

genome coverage

voorbeelde

La combinaison de la profondeur et de la précision du séquençage permet une détection de variants de faible niveau.
The combination of sequencing depth and accuracy allows detection of low level variants.

Le procédé consiste à : obtenir des séquences RAD à extrémité simple brin du génome d'un individu ; filtrer les séquences RAD à extrémité simple brin pour éliminer les séquences qui ne sont pas qualifiées ; effectuer l'analyse statistique des séquences avec le même séquençage pour obtenir l'information en profondeur de chaque séquence ; éliminer par filtration les séquences avec une profondeur de séquençage de 1 ; aligner chaque séquence obtenue en paires sans brèches autorisées pour déterminer les sites hétérozygotes ; et obtenir le taux d'hétérozygotie du génome d'un individu en fonction du nombre total de sites hétérozygotes.
The method comprises: obtaining single-end RAD sequences of the genome of an individual; filtering the single-end RAD sequences to remove the sequences which are unqualified; performing statistical analysis of sequences with the same sequencing to obtain the depth information of each sequence; filtering out the sequences with a sequencing depth of 1; aligning each obtained sequence in pairs with no gaps being allowed to determine the heterozygous sites; and obtaining the heterozygosity rate of the genome of an individual according to the total number of heterozygous sites.

Les chercheurs ont utilisé le fractionnement biochimique, les analyses de séquencage en profondeur, la biologie cellulaire et la mutagénèse non dirigée pour déchiffrer les fonctions de l'AGO1.
The researchers employed biochemical fractionation, deep-sequencing analyses, cell biology and forward genetics to decipher the functions of AGO1.

L'invention concerne un procédé pour le marquage d'un site génomique INDEL, lequel comprend : la prise de données statistiques de la profondeur de séquençage de séquences pour le séquençage d'une extrémité unique de RAD de génomes de deux individus, l'élimination par filtration de séquences d'extrémité unique de RAD, la profondeur de séquençage étant de 1 dans les génomes des deux individus, la détermination d'un site hybride sur des étiquettes RAD à l'intérieur des génomes de deux individus pour former une séquence cohérente, la comparaison des séquences d'étiquette RAD non hybrides des génomes de deux individus avec la séquence cohérente des séquences d'étiquette RAD hybrides, afin de déterminer les informations INDEL sur les étiquettes RAD des deux individus.
Disclosed is a method for tagging a genomic INDEL site, which comprises: taking statistics of the sequencing depth of sequences for RAD single-end sequencing of two individual's genomes, removing, through filtering, RAD single-end sequences with the sequencing depth being 1 in the two individual's genomes, determining a hybrid site on RAD-tags inside the two individual's genomes to form a consistency sequence, comparing non-hybrid RAD-tag sequences of the two individual's genomes with the consistency sequence of the hybrid RAD-tag sequences, so as to determine INDEL information on the RAD-tags of the two individuals.

La bibliothèque de séquençage et le procédé de séquençage, quelle que soit la profondeur du séquençage, peuvent efficacement éliminer les erreurs dans l'amplification de l'ADN et le séquençage de sorte à détecter avec précision les mutations des molécules d'ADN, et sont appropriés pour la construction d'une bibliothèque de séquençage de fragments d'ADN courts traces ou même d'ADN à brin unique.
The sequencing library and sequencing method, under any sequencing depth, can effectively remove errors in DNA amplification and sequencing so as to detect the mutations in DNA molecules accurately, and are suitable for the sequencing library construction of trace short DNA fragments or even single-strand DNA.

En juin 2009, Illumina a annoncé le lancement de son propre service de séquençage génomique personnel à une profondeur de 30X pour 48 000 dollars par génome et un an plus tard a baissé le prix à 19 500 dollars,, puis à 4 000 dollars,.
In June 2009, Illumina announced the launch of their own Personal Full Genome Sequencing Service at a depth of 30X for $48,000 per genome, and a year later dropped the price to $19,500.

En août 2006, les membres de ce projet ont terminé le séquençage du génome bovin (à une profondeur de sept fois) et publié cet assemblage dans des bases de données publiques internationales gratuites.
In August 2006, the project completed sequencing of 7.1-fold coverage of the bovine genome and released this assembly into freely accessible international public databases.

Ainsi, des distorsions liées à la faible profondeur de séquençage atteinte et aux erreurs de séquençage furent identifiés.
As a consequence, biases linked with sampling depth and sequencing errors were identified.

En cas de doute, nous recommandons de déterminer la profondeur de séquençage nécessaire en réalisant un essai sur un sous-groupe d'échantillons.
When in doubt, we recommend determining the required depth of sequencing by performing a trial on a sub-set of samples.

Nous avons exploité la profondeur de séquençage relative des lectures SOLiD pour isoler les séquences répétées des séquences uniques de la séquence de référence.
The relative depth of SOLiD reads was used to filter out repeated sequences from single-copy sequences in the reference sequence.

Les connaissances développées seront également accessibles aux groupes externes en Europe, qui pourront solliciter des services d'accès offerts par les partenaires de TRANSVAC gratuitement; dont l'accès aux adjuvants, modèles animaux, réactifs normalisés et essais biologiques, ainsi qu'aux analyses moléculaires efficaces telles que le séquençage en profondeur et l'analyse de micro-réseaux.
The knowledge developed is also accessible to external groups across Europe, which may apply to access services provided by the TRANSVAC partners free of charge; these include access to adjuvants, animal models, standardised reagents and assays, as well as powerful molecular analysis like deep sequencing and microarray analysis.

L'approche intégrée de l'équipe de recherche impliquera le séquençage en profondeur du génome des tumeurs humaines et murines, et des tests de médicaments in vitro de cultures de tumeur primaire et de lignées de cellules cancéreuses, ainsi que l'analyse computationnelle des données résultantes qui seront utilisées pour effectuer des prévisions de réaction aux médicaments.
The research team's integrated approach will involve the deep genome sequencing of human and mouse tumours, and in vitro drug screens of primary tumor cultures and cancer cell lines, and with computational analysis of the resulting data which will be used to perform drug response predictions.

La profondeur de séquençage requise pour l'analyse du microbiome dépend principalement de la complexité de l'échantillon (nombre et représentation des espèces individuelles) et du but du projet.
The required sequencing depth for microbiome analysis mainly depends on the complexity of the sample (the number and representation of individual species) and the aim of the project.

Finalement, nous tenterons d’adapter ce qu'on appelle le séquençage en profondeur aux études méthylomiques fines de génomes complexes pour obtenir des cartes de méthylation de l’ADN très détaillées pour diverses cellules dans une même expérience.
Finally, we will attempt to adapt the so-called deep sequencing for fine methylomic studies of complex genomes that should generate very detailed DNA methylation maps across a number of cells in one experiment.

L'invention porte sur des procédés pour détecter, entre autres, des molécules d'acide nucléique résistantes à une dégradation, telles qu'une pluralité de molécules d'ARN liées à un ribosome, à l'aide de diverses technologies comprenant un séquençage en profondeur.
Methods are provided for, inter alia, detecting nucleic acid molecules resistant to degradation, such as a plurality of RNA molecules bound to a ribosome, using various technologies including deep sequencing.

Les progrès réalisés dans les techniques de séquençage de l'ADN (acide désoxyribonucléique) ont permis aux chercheurs d'étudier les interactions entre les protéines et l'ADN en profondeur et avec un degré de précision sans précédent.
Advances in DNA (deoxyribonucleic acid) sequencing techniques have made it possible for researchers to study the interactions between proteins and DNA in greater depth and with a higher degree of accuracy than ever before.

Nous avons identifié par séquençage de l’ADNr-16S plusieurs souches isolées à différentes profondeurs dans un filtre (6–8 souches de Bacillus and 6–8 Pseudomonas dans le haut, milieu and bas).
We isolated 6–8 strains of both Bacillus and Pseudomonas from the top, middle, and bottom sections of filters and identified them after 16S rDNA sequencing.

Après avoir obtenu de petites bibliothèques d'ARN des plantes Arabidopsis infectées par C. higginsianum, les chercheurs ont effectué un séquençage en profondeur.
After obtaining small RNA libraries from Arabidopsis plants infected with C. higginsianum, researchers performed deep sequencing.

Les résultats obtenus pour les SNP soulignent les difficultés rencontrées en terme de profondeur du séquençage générant de nombreux contrôles et les difficultés d'alignement des séquences ne rendant pas performant l'analyse des indels.
These results highlighted difficulties in terms of depth and alignment of sequencing reads which generated various false positive SNP?s and indels.

Aujourd'hui, une équipe de Suède et des États-Unis a montré qu'une nouvelle méthode de séquençage génomique, appelée «Smart-Seq», peut aider les scientifiques à mener des analyses des cellules données en profondeur.
But now a research team from Sweden and the United States has shown that a novel genomic sequencing method called 'Smart-Seq' can help scientists conduct in-depth analyses of clinically relevant single cells.

Uniformité de la couverture L'intervalle de profondeurs de couverture d'un génome pour un test de séquençage.
Coverage uniformity The range of coverage depth across a genome for a sequencing run.

Réfléchir au schéma expérimental (nombre d’échantillons, profondeur de lecture et qualité de séquençage)
Determine the optimal experimental design (number of samples, reading depth and sequencing quality)

Les questions complexes de la recherche génomique d'aujourd'hui exigent une profondeur d'information qui dépasse la capacité des technologies traditionnelles de séquençage de l'ADN.
Today's complex genomic research questions demand a depth of information beyond the capacity of traditional DNA sequencing technologies.

L'invention concerne est un procédé de traitement de génome hétérozygote, comprenant l'utilisation d'une stratégie de séquençage aléatoire sur le génome entier pour effectuer le séquençage à très haute profondeur à 200 fois sur une espèce cible afin d'obtenir des lectures efficaces ; l'assemblage des lectures efficaces et l'établissement d'échafaudages afin d'obtenir une carte génomique ayant des séquences redondantes ; la mise en œuvre d'un traitement d’identification du génome hétérozygote sur la carte génomique ayant des séquences redondantes, afin d'éliminer des échafaudages redondants dans les zones hétérozygotes et de retenir les informations de la zone hétérozygote afin d'obtenir la carte du génome entier.
Discloses is a heterozygous genome processing method, comprising using whole genome shotgun strategy to conduct super-high-depth sequencing at 200 times on a target species so as to obtain effective reads; assembling the effective reads and establishing scaffolds so as to obtain a genome map having redundant sequences; performing heterozygous genome identification processing on the genome map having redundant sequences, so as to remove redundant scaffolds in the heterozygous areas and retain the heterozygous area information so as to obtain the whole genome map.

Génotypage par séquençage de faible profondeur (GBS) d'une population bovine: stratégies pour maximiser la sélection des génotypes de haute qualité et la précision de l'imputation
Low-Depth Genotyping-by-Sequencing (GBS) in a Bovine Population: Strategies to Maximize the Selection of High Quality Genotypes and the Accuracy of Imputation