Łącznie jeziora i rzeki zajmują około 4 % powierzchni lądowej Natura 2000 (około 31 560 km2 – obszar większy od terytorium Belgii) i zostały wyznaczone dla takich gatunków, jak łosoś szlachetny Salmo salar, wydra europejska Lutra lutra, zimorodek zwyczajny Alcedo atthis, rak Austropotamobius pallipes, skójka gruboskorupowa Unio crassus, a także typów siedlisk, takich jak nizinne i górskie cieki wodne, lasy łęgowe, łąki podmokłe, wilgotne obszary trawiaste i bagna topogeniczne.
Järved ja jõed katavad kokku ligikaudu 4 % Natura 2000 alade pindalast (ligikaudu 31 560 km2 ehk Belgiast suurem ala), mis on määratud selliste liikide kaitseks nagu lõhe (Salmo salar), saarmas (Lutra lutra), jäälind (Alcedo atthis), valgesõraline vähk (Austropotamobius pallipes) ja paksukojaline jõekarp (Unio crassus), aga ka selliste elupaigatüüpide jaoks nagu tasandikel ja mäestike jalameil voolavad jõed, lammimetsad, luhad, niisked rohumaad ja lodud.Eurlex2018q4 Eurlex2018q4